2012年10月，屏科大鳥類生態研究室接到通知，發現兩隻黑鳶死於含有劇毒農藥「加保扶」。2013年的田野調查中，他們發現大量鳥類在紅豆田中死亡，原因是農民使用加保扶拌稻穀製作毒餌，導致鳥類死亡，進而導致老鷹中毒。

當地政府及相關單位了解情況後，與屏科大鳥類生態研究室展開合作，進行現場調查。這個事件被收錄在生態紀錄片《老鷹想飛》中，凸顯了這樣的問題可能發生在臺灣各地的農田。

為了解決問題，屏科大鳥類生態研究室與當地農民合作，從2014年開始改變種植方法，使用機械播種將紅豆埋入土中，有效減少了鳥害。同時，採收時不使用落葉劑，讓紅豆自然熟成。這種友善農法的轉變成為老鷹紅豆的契機，儘管提高了成本和延後了收成，農民逐漸承受這樣的轉變。

2015年，全聯福利中心董事長及總經理了解老鷹的困境後，積極與臺灣猛禽研究會及屏科大鳥類生態研究室合作，支持老鷹紅豆的銷售。其他農民也受到鼓舞，加入耕種老鷹紅豆，推動保育理念。

近年來，全球對有機農業的關注不斷上升，各國政府和廣大消費者紛紛重視生態友善的農業模式。有機農業的驗證及標章因此成為區分有機和一般農產品的重要依據，也是各國發展有機農業不可或缺的一環。這種趨勢在臺灣得到了印證，特別是在老鷹紅豆的案例中，顯示社會對可持續、生態友善農業的重視。在臺灣，有機農產品的相關法規自1999年起制定，並於2003年9月進行修訂。這一法規體系的實施促成了臺灣有機農業的快速發展。